Técnico: Diego Gutiérrez del Pozo. Ese mismo año, Lanús vuelve a participar de un torneo internacional después de 9 años, al disputar la Copa Sudamericana 2006. Tras eliminar a Corinthians de Brasil, finaliza su participación en cuartos de final, luego de perder la serie ante el Pachuca de México, que eventualmente se coronaría como campeón del certamen. El Madrid se llevó la victoria del Metropolitano por 4-1, y se finalizó la primera vuelta con un nuevo empate a 2, equipacion del atletico de madrid esta vez frente al Betis.
