A raíz de problemas financieros, Atlético Argentino desistió jugar el Torneo Federal B 2017. La Academia decidió dar un paso al costado debido al escaso apoyo en sus arcas para afrontar el certamen, a través del comunicado que emitió, le solicitó al Consejo Federal no perder la plaza y sí poder participar el campeonato posterior. En el año 2018, con la conducción técnica de Pablo Cuello, nuevamente juega la Liga Mendocina de Fútbol, realizando una buena campaña en el torneo Apertura en la cual queda quinto en la tabla de posiciones producto de 10 victorias, 3 empates y 5 derrotas, con 36 goles a favor y 26 goles en contra.
