En el torneo logró ubicarse en el primer lugar general venciendo a equipos como Tigres, camiseta atletico de madrid Necaxa y Monterrey para lograr su clasificación a la liguilla. En la temporada 93-94 el Toluca finalmente logró una mejoría concluyendo su participación en el torneo como tercer lugar general, esa temporada quedó marcada con las llegadas de Hernán Cristante, Nidelson Silva de Mello, Rodrigo Fernández y Blas Armando Giunta así como el regresó a la presidencia de Jesús Fernández del Cojo.
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